Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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BckdkO55028 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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