Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms