Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn34aG3UW52 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms