Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vmn2r40F6W043 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms