Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm3250E9Q1M3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm3250E9Q1M3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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