Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms