Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5930D3Z257 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms