Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518aB2RRF6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms