Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms