Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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