Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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