Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp5Q9Z2P8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms