Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zeb2Q9R0G7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms