Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Col4a4Q9QZR9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms