Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms