Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tomm40Q9QYA2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms