Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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