Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syde1Q9DBZ9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms