Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pdzd9Q9D9M4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdzd9Q9D9M4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdzd9Q9D9M4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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