Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rsph14Q9D3W1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms