Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms