Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rprd1bQ9CSU0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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