Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms