Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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