Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms