Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2B3

Sdha, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhaQ8K2B3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SdhaQ8K2B3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhaQ8K2B3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms