Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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