Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brf1Q8CFK2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brf1Q8CFK2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brf1Q8CFK2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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