Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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