Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg16l1Q8C0J2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Atg16l1Q8C0J2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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