Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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