Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6aQ78XR0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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