Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx13Q6PHS6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms