Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp49Q6P9L4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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