Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop58Q6DFW4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms