Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Ccdc18Q640L5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Ccdc18Q640L5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc18Q640L5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Ccdc18Q640L5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Ccdc18Q640L5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Ccdc18Q640L5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Ccdc18Q640L5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Ccdc18Q640L5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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Ccdc18Q640L5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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