Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms