Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccne1Q61457 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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