Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms