Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3USZ8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3USZ8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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