Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc33Q3ULW6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ccdc33Q3ULW6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ccdc33Q3ULW6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ccdc33Q3ULW6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ccdc33Q3ULW6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms