Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc34Q3UI66 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms