Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms