Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ulk3Q3U3Q1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ulk3Q3U3Q1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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