Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ctdnep1Q3TP92 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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