Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col24a1Q30D77 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms