Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms