Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmem52bQ0VBF2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmem52bQ0VBF2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmem52bQ0VBF2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmem52bQ0VBF2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmem52bQ0VBF2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tmem52bQ0VBF2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Tmem52bQ0VBF2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem52bQ0VBF2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms