Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrioQ0KL02 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms