Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cnn2Q08093 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnn2Q08093 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 360.6 ms